Hvordan kan jeg rydde min tvivl om forskellen mellem en konkurrencedygtig og konkurrencedygtig hæmning af enzymer?


Svar 1:

Konkurrencehæmmende hæmmere binder til den substratbindende del af det aktive sted og blokerer adgangen med substratet.

Mens ukompetitive inhibitorer (UI) kun binder til enzym-substratkomplekset (ES) på steder, der er forskellige fra det substratbindende sted. UI kan ikke binde til et gratis enzym, da det ikke har et bindende sted til det, eller webstedet ikke er tilgængeligt endnu. Binding af et substrat til enzym inducerer en konformationel ændring i enzymet, der gør bindingsstedet tilgængeligt for UI.

Når det binder til ES, forårsager det en reduktion i effektiv koncentration af ES-kompleks, og øger derved enzymer tilsyneladende affinitet for underlaget gennem Le Chateleirs princip (Km sænkes) og formindsker Vmax, som det fremgår af Lineweaver-Burk-plot af UI .

Ved konkurrencedygtig inhibering er Vmax uændret, medens den tilsyneladende affinitet af substratet til bindingsstedet reduceres, stiger Km.

Billedkilde: Google.

PS: Hvis du er nybegynder, så glem plottene, da de kan komplicere tingene. Bare husk, at et CI binder til et frit enzym på det aktive sted, mens UI binder til ES-komplekset på et andet sted end aktivt sted.

Håber dette hjælper.


Svar 2:

Du er nødt til at se på reaktionsordninger. Disse billeder er taget fra en wikipedia-artikel: Enzyminhibitor - Wikipedia

Hvis dette virker uforståeligt, skyldes det, at ovenstående skemaer næsten aldrig afspejler virkeligheden. Ikke-konkurrencedygtig, ikke-konkurrencedygtig og blandet inhibering findes i 2-substratreaktioner, fx A + B → C + D, hvor enzymet har et bindingssted for A og et bindingssted for B.

Kinetiske eksperimenter udføres ved at holde det ene substrat konstant i en række reaktionsrør og variere det andet. Antag, at B holdes konstant, og du måler v vs [A]. Du får en hyperbolsk kurve. Tilføj en konkurrencebegrænsende hæmmer af A, kalder det

IAI_{A}

, og du vil se konkurrencehæmning. Tilføj en konkurrencedygtig hæmmer af B,

IBI_{B}

og du vil se en af ​​de andre former for hæmning.

De fleste lærebøger forklarer ikke, at 2-substratreaktioner er påkrævet til ikke-konkurrencedygtig, konkurrencedygtig og blandet hæmning. Kun Lehninger gør, så vidt jeg ved (“Lehninger,” Nelson og Berg).

En af disse dage vil jeg udarbejde et reaktionsskema for 2-substratreaktioner og sende det.